藥物設計學

定　價：￥58.00

作　者：	唐赟著
出版社：	化學工業(yè)出版社
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京東 (￥58.00)

ISBN：	9787122359933	出版時間：	2020-04-01	包裝：	平裝
開本：	16	頁數(shù)：	361	字數(shù)：

內容簡介

　　《藥物設計學》全書共四篇：導論篇、基礎篇、方法篇、應用篇。其中導論篇（第1章）總體介紹藥物、藥物發(fā)現(xiàn)、藥物設計等基本概念，以及藥物設計的發(fā)展歷程、主要特性；基礎篇（第2～5章）主要介紹藥物設計學的分子基礎、理論基礎、信息學基礎以及傳統(tǒng)藥物設計知識；方法篇（第6～9章）主要介紹藥物靶標識別和預測方法、計算機輔助先導化合物發(fā)現(xiàn)方法、計算機輔助先導化合物優(yōu)化方法、臨床前研究中的藥代動力學性質與毒性預測方法；應用篇（第10章）則為讀者選取了幾個成功的藥物設計實例。本書從基本概念入手，兼顧基礎知識、基本技能和應用實例，整體內容深入淺出，寫作語言淺顯易懂，章節(jié)體系與其它同名教材有較大不同，在傳統(tǒng)藥物設計的基礎上，重點突出計算機輔助藥物設計?！端幬镌O計學》可作為全國高等醫(yī)藥院校藥學專業(yè)及相關專業(yè)的本科生、研究生教材，也可供從事新藥研究和開發(fā)的科研人員參考。

作者簡介

　　唐赟，華東理工大學，教授、博士生導師，長期從事本科教學工作，自2006年開始，一直負責主講藥學本科專業(yè)核心課程“藥物設計學”（32學時），該課程2007年入選華東理工大學精品課程，2010年入選上海市重點課程。同時自2006年開始一直主講研究生專業(yè)課程“計算機輔助藥物設計”（32學時）。已發(fā)表教學研究論文10篇，主編教材1本、參編2本。2009年獲得上海市育才獎，2010年獲得寶鋼教師獎，2012年獲得校教育教學成果獎一等獎、二等獎各1項，2013年獲得上海市教學成果一等獎（第四完成人），2015年獲得“天鼎-東岳”獎教金特等獎，2016年獲得校教書育人獎。科研方面：作者自1991年開始，近三十年來一直從事計算機輔助藥物設計研究，承擔著國家自然科學基金、國家重點研發(fā)專項、863計劃、新藥創(chuàng)制科技重大專項等科研項目10余項，已在J. Med. Chem.， Bioinformatics， Briefings in Bioinformatics， PLoS Comput. Biol.， J. Chem. Inf. Model.等國內外專業(yè)期刊發(fā)表SCI收錄論文近200篇，申請中國發(fā)明專利10項（其中授權4項），獲得計算機軟件著作權4項。2005年入選上海市首批“浦江人才計劃”，2008年入選教育部“新世紀人才支持計劃”。兼任上海市學位委員會學科評議組成員（藥學學科），上海市藥學會藥物化學專業(yè)委員會委員，中國化學會計算機化學專業(yè)委員會委員，中國毒理學會計算毒理專業(yè)委員會委員，上海市新藥設計重點實驗室學術委員會委員，《華東理工大學學報（自然科學版）》編委，美國化學會期刊J. Chem. Inf. Model.顧問編委。主譯學術專著《藥物分子設計－從入門到精通》（當代化學譯叢，華東理工大學出版社，2012年3月出版），參譯學術專著《實用藥物化學》（科學出版社，2012年4月出版）、《創(chuàng)新藥物發(fā)現(xiàn) - 實踐、過程和展望》（華東理工大學出版社，2016年5月出版）。

圖書目錄

緒論1
0．1藥物設計學的形成與發(fā)展1
0．2學習藥物設計學的意義2
0．3本書內容簡介3
思考題4
參考文獻4
第一篇導論篇
第1章藥物設計概述6
1．1什么是藥物？6
1．1．1藥物的基本概念6
1．1．2藥物的主要屬性8
1．1．3藥物的主要來源8
1．1．4藥物發(fā)現(xiàn)的歷史回顧9
1．2什么是藥物設計？10
1．2．1藥物設計的基本概念10
1．2．2藥物設計的主要特性12
1．2．3藥物設計的起源13
1．2．4藥物設計的發(fā)展歷程16
1．3一個經(jīng)典的藥物設計實例18
1．3．1靶標確定18
1．3．2先導化合物發(fā)現(xiàn)19
1．3．3靶標結構模型設想20
1．3．4先導化合物結構優(yōu)化21
1．3．5卡托普利誕生的意義22
1．4藥物設計所需的知識、技能和條件23
本章小結24
思考題25
參考文獻25
拓展閱讀26
第二篇基礎篇
第2章藥物設計的分子基礎28
2．1概述28
2．2藥物分子結構特征29
2．2．1手性30
2．2．2類藥性32
2．2．3藥物分子結構解析33
2．2．4配體效率35
2．3靶標分子結構特征36
2．3．1蛋白質37
2．3．2糖46
2．3．3核酸47
2．4藥物-靶標相互作用原理50
2．4．1藥物作用的分子藥理學基礎50
2．4．2藥物-靶標相互作用模式50
2．4．3藥物-靶標相互作用類型51
本章小結52
思考題52
參考文獻52
拓展閱讀53
第3章藥物設計的理論基礎54
3．1概述54
3．2分子模擬基本知識55
3．2．1幾個常用名稱56
3．2．2分子文件格式57
3．3量子力學60
3．3．1量子力學的起源60
3．3．2量子力學基本理論62
3．3．3量子力學計算方法64
3．3．4量子化學在藥物研究中的應用66
3．4分子力學70
3．4．1分子力學力場70
3．4．2常用的分子力場72
3．4．3分子力學與量子力學比較74
3．5分子動力學75
3．5．1分子動力學基本原理76
3．5．2常用分子動力學方法76
3．5．3分子動力學模擬的應用77
3．6結合自由能計算80
3．6．1自由能微擾和熱力學積分方法81
3．6．2基于經(jīng)驗方程的結合自由能計算方法83
3．6．3基于分子動力學采樣的自由能預測方法85
本章小結88
思考題88
參考文獻89
拓展閱讀90
第4章藥物設計的信息學基礎91
4．1概述91
4．2信息學基礎知識93
4．2．1數(shù)據(jù)庫基礎93
4．2．2統(tǒng)計學基礎95
4．3信息處理的基本方法97
4．3．1信息處理的一般流程97
4．3．2學習策略98
4．3．3統(tǒng)計分析方法99
4．3．4機器學習方法100
4．3．5神經(jīng)網(wǎng)絡與深度學習104
4．3．6模型評價107
4．3．7模型構建工具109
4．4化學信息處理111
4．4．1化學分子結構表達112
4．4．2分子結構的數(shù)學描述115
4．4．3分子相似性計算118
4．4．4預測模型構建119
4．4．5虛擬化合物庫設計121
4．5生物信息處理123
4．5．1序列分析124
4．5．2蛋白質結構預測125
4．5．3同源模建127
4．5．4序列比對和結構預測的在線資源和工具128
本章小結129
思考題129
參考文獻130
拓展閱讀131
第5章傳統(tǒng)藥物設計方法132
5．1概述132
5．2先導化合物的發(fā)現(xiàn)133
5．2．1基于天然產(chǎn)物活性成分發(fā)現(xiàn)先導化合物133
5．2．2基于內源性生物活性物質發(fā)現(xiàn)先導化合物134
5．2．3基于藥物的副作用發(fā)現(xiàn)先導化合物135
5．2．4基于藥物的代謝作用發(fā)現(xiàn)先導化合物136
5．2．5化合物庫篩選發(fā)現(xiàn)先導化合物136
5．2．6其它途徑137
5．3先導化合物優(yōu)化原則137
5．4生物電子等排原理138
5．4．1“生物電子等排體”的由來138
5．4．2生物電子等排體的類型139
5．4．3生物電子等排原理的應用140
5．5前藥原理142
5．5．1前藥的定義及基本特征142
5．5．2前藥設計時需要考慮的問題143
5．5．3前藥原理的應用144
5．6拼合原理146
5．7其它先導化合物優(yōu)化方法147
本章小結149
思考題149
參考文獻149
拓展閱讀150
第三篇方法篇
第6章藥物靶標識別與預測152
6．1概述152
6．2靶標識別與確證153
6．3網(wǎng)絡藥理學與靶標預測154
6．4基于結構的靶標預測157
6．4．1反向分子對接158
6．4．2反向藥效團匹配159
6．5基于配體的靶標預測160
6．5．1相似性搜索160
6．5．2機器學習162
6．6基于網(wǎng)絡的靶標預測164
6．6．1基于網(wǎng)絡推理方法164
6．6．2藥物子結構驅動的網(wǎng)絡推理算法168
6．6．3基于隨機游走方法170
6．6．4基于基因表達譜方法171
6．7靶標預測方法的應用172
6．7．1藥物重定位173
6．7．2活性化合物的潛在靶標預測177
6．8靶標預測的在線資源和工具180
本章小結182
思考題183
參考文獻183
拓展閱讀186
第7章計算機輔助先導化合物發(fā)現(xiàn)187
7．1合理藥物設計概述187
7．2分子對接189
7．2．1分子對接基本概念189
7．2．2分子對接的一般流程190
7．2．3配體構象搜索方法191
7．2．4受體柔性處理方法193
7．2．5打分函數(shù)194
7．2．6分子對接工具197
7．2．7分子對接的應用198
7．3藥效團模建199
7．3．1藥效團基本概念199
7．3．2藥效團特征199
7．3．3藥效團模型的構建201
7．3．4藥效團模型的應用202
7．4虛擬篩選203
7．4．1虛擬篩選概念203
7．4．2基于結構的虛擬篩選204
7．4．3基于配體的虛擬篩選206
7．4．4虛擬篩選的應用210
7．5全新藥物設計211
7．5．1全新設計的基本概念211
7．5．2全新設計的一般流程212
7．5．3全新藥物設計的應用216
7．6應用實例217
7．6．1研究背景217
7．6．2基于結構虛擬篩選發(fā)現(xiàn)ERβ選擇性配體218
7．6．3基于活性化合物的相似性搜索221
7．6．4ER配體藥效團模型構建222
7．6．5采用組合虛擬篩選策略發(fā)現(xiàn)新型選擇性ERβ配體223
7．6．6研究小結227
本章小結227
思考題228
參考文獻228
拓展閱讀230
第8章計算機輔助先導化合物優(yōu)化231
8．1概述231
8．2經(jīng)典QSAR方法232
8．2．1QSAR基本概念232
8．2．2QSAR發(fā)展簡史233
8．2．3QSAR的三個支柱235
8．2．4QSAR模型構建步驟239
8．2．5QSAR建模的注意事項240
8．2．6QSAR應用241
8．2．7相關軟件和網(wǎng)絡資源242
8．33D-QSAR方法242
8．3．1CoMFA方法243
8．3．2CoMSIA方法244
8．3．3基于靶標結構的3D-QSAR方法245
8．3．43D-QSAR應用實例245
8．4基于結構的先導化合物優(yōu)化252
8．4．1分子模擬技術的應用252
8．4．2基團變換策略253
8．4．3合環(huán)開環(huán)策略255
8．4．4鄰位修飾策略257
8．4．5肽鍵變換策略258
8．5骨架躍遷259
8．5．1骨架的定義259
8．5．2骨架躍遷的起源和發(fā)展259
8．5．3骨架相似性的量度261
8．5．4骨架躍遷的方法分類261
8．5．5骨架躍遷的應用266
8．6基于性質的先導化合物優(yōu)化266
8．6．1分子骨架庫構建266
8．6．2骨架指紋的定義268
8．6．3骨架躍遷的程序實現(xiàn)269
8．6．4ADMET性質優(yōu)化案例271
本章小結273
思考題274
參考文獻274
拓展閱讀276
第9章藥代動力學性質與毒性預測277
9．1概述277
9．2藥物的體內過程278
9．3ADMET預測的一般流程280
9．4藥物理化性質預測281
9．4．1脂溶性282
9．4．2水溶性283
9．4．3pKa值285
9．5藥代動力學性質預測287
9．5．1吸收287
9．5．2分布291
9．5．3代謝298
9．6藥物毒性預測306
9．6．1藥物毒理學簡介306
9．6．2計算毒理學的出現(xiàn)和發(fā)展307
9．6．3毒性預測模型308
9．6．4警示子結構識別314
9．7相關軟件和網(wǎng)絡資源317
本章小結320
思考題320
參考文獻320
拓展閱讀325
第四篇應用篇
第10章藥物設計應用實例328
10．1概述328
10．1．1基于配體藥物設計的成功實例329
10．1．2基于結構藥物設計的成功實例330
10．2靶向神經(jīng)氨酸酶的抗流感病毒藥物設計332
10．2．1酶抑制劑設計概述332
10．2．2流感與神經(jīng)氨酸酶332
10．2．3扎那米韋的設計334
10．2．4奧司他韋的設計335
10．2．5案例啟示336
10．3靶向μ阿片受體的新型鎮(zhèn)痛藥物設計337
10．3．1GPCR配體設計337
10．3．2鎮(zhèn)痛藥與阿片受體338
10．3．3新型鎮(zhèn)痛藥的設計過程339
10．3．4案例啟示341
10．4靶向MDM2-p53相互作用界面的抗腫瘤藥物設計341
10．4．1蛋白-蛋白相互作用341
10．4．2腫瘤與MDM2-p53相互作用342
10．4．3MDM2抑制劑的發(fā)現(xiàn)歷程344
10．4．4案例啟示346
10．5靶向雄激素受體-DNA相互作用界面的抗腫瘤藥物設計346
10．5．1蛋白質-DNA相互作用346
10．5．2雄激素受體與前列腺癌346
10．5．3虛擬篩選獲得苗頭化合物347
10．5．4CADD輔助先導化合物優(yōu)化348
10．5．5案例啟示348
本章小結349
思考題349
參考文獻349
拓展閱讀351
中文索引/ 352
英文索引/ 357