野生熱帶水果植物：木奶果

第1章 木奶果概述 
1.1 木奶果的生物學特性 
1.2 木奶果的應用價值 
第2章 木奶果的植物群落特征 
2.1 植物群落特征研究進展 
2.1.1 植物群落的研究內(nèi)容 
2.1.2 亞熱帶森林不同演替階段的群落特征變化 
2.2 群落野外調(diào)查 
2.2.1 群落調(diào)查點概況 
2.2.2 群落調(diào)查方法 
2.3 木奶果群落現(xiàn)狀 
2.3.1 群落物種組成與區(qū)系分析 
2.3.2 群落結構特征 
2.4 木奶果群落特征 
2.4.1 群落組成與區(qū)系分析 
2.4.2 不同齡組木奶果陰生與陽生特征分析 
2.4.3 群落結構與演替分析 
2.4.4 木奶果在不同年齡段的陰生與陽生特征分析 
第3章 木奶果的栽培技術 
3.1 木奶果的繁殖 
3.1.1 種子繁殖 
3.1.2 軒插繁殖 
3.1.3 高壓繁殖 
3.1.4 嫁接繁殖 
3.2 植物光適應性研究的意義 
3.2.1 遮陰對植物生長的影響 
3.2.2 遮陰對植物生理特性的影響 
3.3 木奶果的幼苗栽培技術 
3.3.1 試驗地概況 
3.3.2 試驗材料 
3.3.3 試驗方法 
3.3.4 指標測定的方法 
3.3.5 木奶果幼苗的光適應性響應 
3.3.6 木奶果幼苗的栽培關鍵技術 
第4章 木奶果的基因組 
4.1 基因組學對果實性狀研究的意義 
4.2 木奶果基因組測序 
4.2.1 DNA提取及文庫構建 
4.2.2 數(shù)據(jù)過濾及質(zhì)控 
4.2.3 RNA提取及建庫、質(zhì)檢和測序 
4.2.4 基因組組裝及評估 
4.2.5 基因組注釋 
4.2.6 木奶果基因家族的收縮和擴張及系統(tǒng)進化分析 
4.2.7 木奶果全基因組復制事件和共線性分析 
4.3 木奶果全基因組測序統(tǒng)計 
4.3.1 測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計 
4.3.2 基因組評估 
4.3.3 基因組組裝及質(zhì)量評估 
4.3.4 基因組注釋及質(zhì)量評估 
4.4 木奶果的比較基因組 
4.4.1 木奶果與近緣種的同源基因比較 
4.4.2 系統(tǒng)進化與基因家族擴張收縮分析 
4.4.3 全基因組復制及共線性分析 
4.5 木奶果全基因組測序分析 
4.5.1 木奶果基因組測序評估 
4.5.2 木奶果基因組組裝 
4.5.3 木奶果基因組結構 
4.5.4 木奶果比較基因組 
第5章 木奶果的果肉品質(zhì)代謝組學研究 
5.1 代謝組學在果品研究中的意義 
5.2 木奶果果實發(fā)育的代謝組學 
5.2.1 材料 
5.2.2 樣品采集 
5.2.3 代謝物提取 
5.2.4 UPLC-MS/MS分析 
5.2.5 數(shù)據(jù)質(zhì)控 
5.2.6 MS數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計分析 
5.3 木奶果的果肉代謝組 
5.3.1 代謝物數(shù)據(jù)質(zhì)控 
5.3.2 木奶果果肉主要成分 
5.3.3 LR5和BR5成熟期差異代謝物分析 
5.3.4 木奶果果肉的主要營養(yǎng)物質(zhì)及代謝變化 
5.3.5 木奶果果實保存期分析 
5.3.6 果肉完全成熟期代謝物的KEGG富集 
5.4 木奶果果肉主要性狀分析 
5.4.1 果肉口味關鍵代謝物 
5.4.2 果肉顏色主要成分 
5.4.3 木奶果果實保存期 
第6章 木奶果的果品調(diào)控轉(zhuǎn)錄組學研究 
6.1 果品主要性狀的研究背景 
6.1.1 轉(zhuǎn)錄組學在果實性狀研究中的意義 
6.1.2 轉(zhuǎn)錄組學和代謝組學在果實性狀研究中的意義 
6.1.3 類黃酮和花色苷合成途徑 
6.1.4 可溶性糖和有機酸代謝途徑 
6.2 木奶果果肉的轉(zhuǎn)錄組學 
6.2.1 RNA提取及檢測 
6.2.2 文庫構建及測序 
6.2.3 木奶果果肉測序數(shù)據(jù)質(zhì)控及評估 
6.2.4 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對 
6.2.5 差異表達基因分析 
6.2.6 轉(zhuǎn)錄因子分析 
6.2.7 qRT-PCR實驗 
6.3 木奶果果肉轉(zhuǎn)錄組分析 
6.3.1 木奶果不同發(fā)育期果肉樣品測序數(shù)據(jù)評估 
6.3.2 基因表達量分析 
6.3.3 木奶果果肉發(fā)育期DEGs分析 
6.3.4 木奶果果肉發(fā)育中DEGs的GO功能富集分析 
6.3.5 木奶果果實發(fā)育中DEGs的KEGG富集分析 
6.3.6 木奶果果肉中類黃酮代謝途徑中的基因表達式樣分析 
6.3.7 可溶性糖和有機酸代謝途徑基因表達式樣分析 
6.3.8 轉(zhuǎn)錄因子分析 
6.3.9 果實發(fā)育過程中DEGs的qRT-PCR驗證 
6.4 木奶果果肉主要性狀的差異表達基因 
6.4.1 木奶果果實成熟發(fā)育過程中DEGs分析 
6.4.2 木奶果果肉顏色相關的關鍵基因 
6.4.3 木奶果果肉可溶性糖和有機酸代謝途徑的關鍵基因 
第7章 結論與展望 
7.1 本書主要結論 
7.1.1 木奶果群落和幼苗光適應分析 
7.1.2 木奶果基因組分析 
7.1.3 木奶果果肉代謝組分析 
7.1.4 木奶果果肉轉(zhuǎn)錄組分析 
7.2 創(chuàng)新點 
7.3 展望 
7.3.1 木奶果群落和幼苗光適應的研究展望 
7.3.2 基于木奶果基因組的果肉顏色和口味形成機制研究展望 
參考文獻 
附錄