微生物生物學（第二版）

目錄
第二版序言
第一版序言
第二版前言
第一章 緒論 1
一、微生物及其特點 1
二、微生物在生物界中的地位 1
三、微生物學的研究范疇 3
四、微生物學的發(fā)展歷程 3
五、微生物學的最新趨勢 8
復習思考題 12
拓展閱讀 12
第二章 細菌 14
第一節(jié) 細菌的形態(tài) 14
一、細菌的個體形態(tài)和大小 14
二、細菌的繁殖和群體形態(tài) 17
第二節(jié) 細菌的結(jié)構(gòu)和功能 19
一、細胞壁 19
二、細胞質(zhì)膜 25
三、擬核和質(zhì)粒 27
四、間體及其他內(nèi)膜結(jié)構(gòu) 27
五、細胞質(zhì)及其內(nèi)含物 30
六、細菌細胞的特殊結(jié)構(gòu) 33
第三節(jié) 放線菌 40
一、放線菌的個體形態(tài) 41
二、放線菌的繁殖和群體形態(tài) 43
第四節(jié) 藍細菌 44
一、藍細菌的形態(tài)和結(jié)構(gòu)特征 44
二、藍細菌的繁殖 46
第五節(jié) 其他細菌類群 46
一、螺旋體 46
二、黏細菌 47
三、鞘細菌 48
四、立克次氏體 49
五、衣原體 50
六、支原體 51
七、蛭弧菌 52
復習思考題 53
拓展閱讀 53
第三章 古菌 56
第一節(jié) 古菌的主要特征 56
一、古菌的細胞結(jié)構(gòu) 56
二、古菌的遺傳學特征 58
第二節(jié) 古菌的主要類群 60
一、產(chǎn)甲烷古菌 60
二、極端嗜鹽古菌 61
三、極端嗜熱的代謝元素硫的古菌 63
四、無細胞壁的古菌 64
五、還原硫酸鹽/Fe3+的古菌 64
六、氨氧化古菌 65
七、與其他古菌共生的超微古菌 65
復習思考題 65
拓展閱讀 66
第四章 真核微生物 68
第一節(jié) 真菌 68
一、真菌的形態(tài)和細胞結(jié)構(gòu) 68
二、菌絲結(jié)構(gòu) 74
三、無性繁殖 76
四、有性繁殖 79
五、真菌的形態(tài)形成 85
六、真菌的菌落 87
第二節(jié) 黏菌 87
一、黏菌的形態(tài) 88
二、黏菌的生活周期 90
三、黏菌的培養(yǎng) 92
四、黏菌的形態(tài)建成 92
復習思考題 93
拓展閱讀 93
第五章 病毒 95
第一節(jié) 病毒的研究歷史 95
一、病毒病的經(jīng)驗認知時期 95
二、病毒的發(fā)現(xiàn)時期 95
三、病毒本質(zhì)的研究時期 96
四、病毒的分子生物學研究時期 96
第二節(jié) 病毒的形態(tài)結(jié)構(gòu)和化學組成 96
一、病毒的特征和定義 96
二、病毒粒子的形態(tài)和大小 97
三、病毒粒子的基本結(jié)構(gòu) 98
四、病毒粒子的化學組成 100
第三節(jié) 病毒的分類與命名 102
一、病毒分類的原則 104
二、病毒分類體系和命名規(guī)則 104
第四節(jié) 病毒的侵染與復制 104
一、吸附 105
二、侵入 105
三、脫殼 105
四、病毒大分子的生物合成 106
五、病毒的裝配和釋放 109
第五節(jié) 病毒與寄主的相互作用 109
一、噬菌體與宿主的相互作用 110
二、動物病毒與寄主的相互作用 114
三、植物病毒與寄主的相互作用 115
第六節(jié) 亞病毒 118
一、類病毒 118
二、衛(wèi)星病毒 119
三、衛(wèi)星核酸 119
四、朊病毒 120
五、缺陷干擾顆粒 121
第七節(jié) 幾種重要病毒的特征 122
一、動物病毒 122
二、植物病毒 125
復習思考題 127
拓展閱讀 127
第六章 微生物的營養(yǎng) 129
第一節(jié) 微生物細胞的化學組成和營養(yǎng)要求 129
一、微生物細胞的元素組成 129
二、微生物細胞中的有機化合物 130
三、微生物營養(yǎng)物質(zhì)的來源和功能 132
第二節(jié) 微生物的營養(yǎng)類型 137
一、光能無機營養(yǎng)型 137
二、光能有機營養(yǎng)型 139
三、化能無機營養(yǎng)型 139
四、化能有機營養(yǎng)型 140
第三節(jié) 培養(yǎng)基 141
一、培養(yǎng)基的配制原則 142
二、培養(yǎng)基的類型及其應用 144
第四節(jié) 微生物吸收營養(yǎng)物質(zhì)的機制 146
一、被動擴散 146
二、促進擴散 146
三、主動運輸 147
四、基團轉(zhuǎn)移 149
五、鐵的吸收 152
復習思考題 154
拓展閱讀 154
第七章 微生物的代謝 156
第一節(jié) 微生物的能量代謝 156
一、ATP的結(jié)構(gòu)與生成 156
二、微生物的產(chǎn)能代謝 161
三、能量的利用 165
第二節(jié) 微生物的分解代謝 166
一、己糖的分解 166
二、丙酮酸代謝的多樣性 170
三、多糖的分解 175
四、蛋白質(zhì)的分解 175
五、氨基酸的分解 176
六、脂肪和其他有機物的分解 177
第三節(jié) 微生物的合成代謝 177
一、無機養(yǎng)料的同化 178
二、前體分子及其大分子的合成 182
三、細胞壁的合成 187
四、次生代謝及其產(chǎn)物 188
第四節(jié) 微生物的代謝調(diào)控（基于酶水平的調(diào)控） 190
一、酶活性的調(diào)節(jié) 190
二、代謝調(diào)節(jié)的應用 193
復習思考題 194
拓展閱讀 194
第八章 微生物的生長與環(huán)境條件 196
第一節(jié) 微生物的生長和測定方法 196
一、微生物的生長 196
二、微生物生長的測定方法 199
三、細菌的群體生長—生長曲線 203
四、細菌的二次生長、同步生長和連續(xù)培養(yǎng) 205
五、真菌生長的測定 210
第二節(jié) 環(huán)境條件對微生物生長的影響 211
一、溫度 211
二、水活度和滲透壓 214
三、酸堿度 216
四、O2和Eh 217
五、輻射 218
六、超聲波 220
七、控制微生物的化學藥劑 220
復習思考題 224
拓展閱讀 224
第九章 微生物遺傳和變異 227
第一節(jié) 微生物遺傳物質(zhì)的存在方式 227
一、原核微生物的遺傳物質(zhì) 227
二、真核微生物的遺傳物質(zhì) 228
三、DNA的結(jié)構(gòu)與復制 230
第二節(jié) 微生物基因和基因組 232
一、基因和基因表達 232
二、微生物的基因組 234
第三節(jié) 微生物的核外遺傳因子 238
一、細菌的質(zhì)粒 238
二、轉(zhuǎn)座遺傳因子 242
三、真菌染色體外的遺傳因子 244
第四節(jié) 微生物的基因重組 250
一、原核生物的基因重組 250
二、真菌的基因重組 258
第五節(jié) 微生物的基因突變 262
一、突變的概念 263
二、突變體的類型和分離方法 264
三、突變的分子機制 268
四、誘發(fā)突變及其分子機理 277
五、DNA損傷的修復 282
第六節(jié) 微生物基因表達的調(diào)控 288
一、基因表達的誘導和阻遏 288
二、微生物基因表達調(diào)控的基本方式 290
三、酵母菌基因表達的調(diào)控特點及其與原核微生物的區(qū)別 303
復習思考題 305
拓展閱讀 306
第十章 微生物生態(tài) 310
第一節(jié) 生物圈和生態(tài)系統(tǒng) 310
第二節(jié) 微生物的自然環(huán)境 311
一、微環(huán)境和生態(tài)位 311
二、生物膜和微生物墊 312
三、微生物與生態(tài)系統(tǒng) 313
第三節(jié) 自然界中的微生物 314
一、土壤中的微生物 314
二、水體中的微生物 318
三、空氣中的微生物 320
四、巖石圈中的微生物 322
五、食品中的微生物 322
六、極端環(huán)境中的微生物 323
七、未能培養(yǎng)的微生物 326
第四節(jié) 微生物生態(tài)學的研究方法 327
一、富集法與分離法 327
二、維諾格拉斯基柱法 329
三、生態(tài)環(huán)境中微生物的直接檢測和測數(shù) 330
四、16S rDNA擴增和序列分析 331
五、生態(tài)環(huán)境中微生物活性的測定 331
六、未培養(yǎng)微生物的檢測及研究方法 334
第五節(jié) 微生物在自然界物質(zhì)循環(huán)中的作用 337
一、碳素循環(huán) 338
二、氮素循環(huán) 340
三、硫素循環(huán) 342
四、磷素循環(huán) 344
五、鐵素循環(huán) 344
第六節(jié) 微生物間的相互關系 345
一、中性關系 346
二、偏利作用 346
三、初級合作 346
四、互惠共生 347
五、競爭關系 347
六、拮抗作用 348
七、寄生關系 349
八、捕食關系 349
第七節(jié) 微生物與高等植物間的相互關系 350
一、植物的根圈與根圈微生物 350
二、植物內(nèi)生菌 351
三、微生物與高等植物間的共生關系 352
四、植物莖葉和果實上的微生物 358
五、微生物引起的植物病害 359
第八節(jié) 微生物與人和動物間的相互關系 362
一、互生關系 363
二、捕食關系 364
三、共生關系 364
四、寄生關系的病原微生物 368
復習思考題 368
拓展閱讀 369
第十一章 微生物的感染與免疫 372
第一節(jié) 感染 372
一、病原微生物感染宿主的過程 372
二、病原微生物感染造成損傷 374
第二節(jié) 免疫 377
一、固有免疫 378
二、適應性免疫 384
第三節(jié) 超敏反應 395
一、Ⅰ型超敏反應 395
二、Ⅱ型超敏反應 397
三、Ⅲ型超敏反應 398
四、Ⅳ型超敏反應 398
復習思考題 399
拓展閱讀 399
第十二章 微生物的分類 401
第一節(jié) 微生物的多層次分類單元 402
一、種的概念 402
二、種以下的等級 403
三、菌株 403
四、屬、科、目和域的劃分 403
五、微生物分類單元的命名 404
第二節(jié) 細菌分類方法 405
一、傳統(tǒng)分類法 405
二、數(shù)值分類法 407
三、化學分類法 411
四、遺傳學分類法 412
第三節(jié) 細菌分類系統(tǒng)和常見的原核生物類群 417
一、細菌分類系統(tǒng) 417
二、常見細菌類群的代表 420
三、常見古菌類群的代表 429
第四節(jié) 真菌分類 432
一、真菌分類常用的分子生物學方法 432
二、以往常用的真菌分類系統(tǒng) 433
三、常見真菌類群的代表 437
復習思考題 450
拓展閱讀 451
第十三章 微生物的應用 453
第一節(jié) 微生物在農(nóng)業(yè)和環(huán)境保護中的應用 453
一、微生物接種劑 453
二、農(nóng)用抗生素 458
三、單細胞蛋白 459
四、污染物的微生物降解與轉(zhuǎn)化 460
五、污染環(huán)境的微生物治理與修復 463
第二節(jié) 微生物工業(yè)發(fā)酵 467
一、通風型發(fā)酵罐 468
二、厭氧型發(fā)酵罐 469
三、空氣過濾系統(tǒng) 469
四、發(fā)酵后處理的工藝 470
第三節(jié) 代表性微生物的工業(yè)發(fā)酵產(chǎn)品和工藝簡介 470
一、酵母菌的酒精發(fā)酵與含酒精飲料的制備 471
二、抗生素的工業(yè)發(fā)酵 473
三、檸檬酸的工業(yè)發(fā)酵 474
四、氨基