計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)

第1章 分子模擬的數(shù)學(xué)基礎(chǔ)
1．1 級(jí)數(shù)
1．2 積分的概念和方法
第2章 分子模擬的生物信息學(xué)基礎(chǔ)
2．1 序列比對(duì)
2．2 序列分析
2．3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2．4 基因芯片技術(shù)
2．5 各種數(shù)據(jù)庫和網(wǎng)絡(luò)資源
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第3章 分子模擬的物理和化學(xué)基礎(chǔ)
3．1 原子間與分子問作用力
3．2 分子力場(chǎng)
3．3 幾種常見的分子力場(chǎng)
3．4 多體問題和有效成對(duì)勢(shì)能
3．5 溶劑介電質(zhì)模型
3．6 量子化學(xué)計(jì)算的基本原理
3．7 密度泛函理論
參考文獻(xiàn)
第4章 分子模擬基本算法
4．1 統(tǒng)計(jì)力學(xué)基礎(chǔ)
4．2 MonteCarlo模擬
4．3 分子模擬
4．4 從頭算分子動(dòng)力學(xué)簡(jiǎn)介
4．5 QM/MM簡(jiǎn)介
4．6 能量?jī)?yōu)化算法與過渡態(tài)求解
參考文獻(xiàn)
第5章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
5．1 同源模建
5．2 反相折疊方法
5．3 從頭折疊法
5．4 常用的網(wǎng)站
5．5 常用軟件
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第6章 藥物設(shè)計(jì)的統(tǒng)計(jì)方法
6．1 早期的探索
6．2 二維定量構(gòu)效關(guān)系
6．3 三維定量構(gòu)效關(guān)系
6．4 更高維定量構(gòu)效關(guān)系
6．5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析方法
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第7章 藥物設(shè)計(jì)的信息系統(tǒng)
7．1 化學(xué)信息系統(tǒng)
7．2 組合化學(xué)信息管理系統(tǒng)
7．3 生物信息數(shù)據(jù)庫和軟件
7．4 數(shù)據(jù)庫搜索技術(shù)
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第8章 藥物代謝與精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)
8．1 細(xì)胞色素P450 酶簡(jiǎn)介
8．2 細(xì)胞色素P450 酶在生物信息學(xué)、功能基因組學(xué)及代謝組學(xué)中的研究
8．3 單核苷酸多態(tài)性與精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)
8．4 人類細(xì)胞色素P450 酶中單核苷酸多態(tài)性的精準(zhǔn)預(yù)測(cè)
8．5 單核苷酸多態(tài)性對(duì)細(xì)胞色素P450 酶活性的影響
參考文獻(xiàn)
第9章 藥物組合與多靶標(biāo)藥物設(shè)計(jì)
9．1 化學(xué)相似性系綜法預(yù)測(cè)蛋白一配體相互關(guān)系
9．2 基于化學(xué)傾向性的蛋白一配體關(guān)系預(yù)測(cè)
9．3 基于藥物作用網(wǎng)絡(luò)和信號(hào)通路的藥物對(duì)組合研究
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第10章 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)應(yīng)用實(shí)例
10．1 抗SARS的藥物設(shè)計(jì)
10．2 HIV蛋白酶抑制劑的篩選
10．3 流感病毒神經(jīng)氨酸酶抑制劑的研究
10．4 定量構(gòu)效關(guān)系與嗯唑烷酮抗菌藥物的設(shè)計(jì)
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第11章 花椒素的發(fā)現(xiàn)及其藥理藥效
11．1 阿爾茨海默病與煙堿乙酰膽堿受體
11．2 花椒素的發(fā)現(xiàn)和結(jié)構(gòu)改造
11．3 花椒素抗老年癡呆的研究
11．4 花椒素的安全性
11．5 花椒素對(duì)皮膚的抗衰老作用
11．6 小結(jié)
附錄18 個(gè)小分子的結(jié)構(gòu)
參考文獻(xiàn)
索引
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