分子動力學模擬的理論與實踐

定　價：￥85.00

作　者：	嚴六明、朱素華
出版社：	科學出版社
叢編項：
標　簽：	科學與自然生物科學

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ISBN：	9787030373595	出版時間：	2013-05-01	包裝：	平裝
開本：	16開	頁數(shù)：	248	字數(shù)：

內(nèi)容簡介

　　分子動力學模擬是近年來飛速發(fā)展的一種分子模擬方法，它以經(jīng)典力學、量子力學、統(tǒng)計力學為基礎(chǔ)，利用計算機數(shù)值求解分子體系運動方程的方法，模擬研究分子體系的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)。作為繼實驗和理論兩種研究方法之后，研究分子體系結(jié)構(gòu)與性質(zhì)的第三種科學研究方法，分子動力學模擬已經(jīng)被廣泛應用于化學化工、材料科學與工程、物理、生物醫(yī)藥等科學和技術(shù)領(lǐng)域，起到越來越重要的作用。全書共11章：第1章為緒言；第2～4章為分子的經(jīng)典力學模型，包括分子的物理模型、分子間相互作用以及常用分子力場；第5～8章為經(jīng)典分子動力學模擬與第一性原理分子動力學模擬的基本原理與方法，包括分子體系的運動方程及其數(shù)值解、分子動力學模擬的技巧、MD模擬的統(tǒng)計力學基礎(chǔ)、第一性原理分子動力學模擬；第9章和第10章分別為分子動力學模擬的應用、分子力場的構(gòu)建與MD模擬的應用實例；第11章為與MD模擬有關(guān)的其他分子模擬方法。本書可作為化學化工、材料科學與工程、物理、生物醫(yī)藥等有關(guān)專業(yè)領(lǐng)域的高校教師、科研人員的參考書和研究生教材。

作者簡介

暫缺《分子動力學模擬的理論與實踐》作者簡介

圖書目錄

序
前言
第1章緒言
1.1 分子動力學模擬的發(fā)展歷史
1.2 MD模擬的應用與意義
1.3 MD模擬的發(fā)展趨勢
第2章分子的物理模型
2.1 分子的物理模型在化學中的作用
2.2 原子、分子的幾何模型
2.3 分子的經(jīng)典力學模型
2.4 分子的量子力學模型
第3章分子間相互作用
3.1 分子間相互作用與勢函數(shù)
3.2 分子間特殊勢函數(shù)
3.3 分子間相互作用的起源
3.4 氫鍵相互作用
3.5 常用分子間相互作用勢函數(shù)
3.6 無機巨分子物質(zhì)的勢函數(shù)
3.7 金屬勢
3.8 近程相互作用和長程相互作用
第4章常用分子力場
4.1 水分子力場
4.2 分子力場的種類
4.3 MMn系列分子力場
4.4 全原子分子力場
4.5 聯(lián)合原子分子力場
4.6 量子化學分子力場
4.7 通用力場
第5章分子體系的運動方程及其數(shù)值解
5.1 分子體系的運動方程(牛頓第二定律)
5.2 分子體系的運動方程(哈密頓運動方程)
5.3 常微分方程的數(shù)值解
5.4 分子體系運動方程的求解思路
5.5 分子體系運動方程的數(shù)值解
5.6 剛體運動方程的解
5.7 約束動力學
第6章分子動力學模擬的技巧
6.1 周期性邊界條件
6.2 勢函數(shù)的計算技巧
6.3 長程力的計算
6.4 溫度和壓力控制技術(shù)
第7章 MD模擬的統(tǒng)計力學基礎(chǔ)
7.1 熱力學的基本概念
7.2 統(tǒng)計系綜和可實現(xiàn)狀態(tài)
7.3 各態(tài)歷經(jīng)假設與MD模擬
7.4 體系可實現(xiàn)狀態(tài)數(shù)的估計
7.5 統(tǒng)計系綜的概率分布
7.6 非Hamilton體系的統(tǒng)計理論
7.7 演化算符與差分格式
第8章第一性原理分子動力學模擬
8.1 經(jīng)典MD模擬的局限性
8.2 BOMD和CPMD模擬方法
8.3 平面波基函數(shù)
8.4 贗勢
8.5 PIMD模擬
8.6 質(zhì)子在甲醇分子和水分子之間遷移過程的AIMD模擬
第9章分子動力學模擬的應用
9.1 MD模擬的計算機軟硬件
9.2 模擬體系分子模型的建立
9.3 MD模擬的初始條件
9.4 MD模擬技術(shù)參數(shù)的確定
9.5 MD模擬的過程
9.6 MD模擬結(jié)果的處理
第10章分子力場的構(gòu)建與MD模擬的應用實例
10.1 聚炔分子力場的構(gòu)建
10.2 鋰離子電池電解液的MD模擬
第11章與MD模擬有關(guān)的其他分子模擬方法
11.1 非平衡分子動力學模擬
11.3 耗散粒子動力學
11.4 Monte Carlo模擬
參考文獻
附錄術(shù)語約定
索引