蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)

第1章緒論
1.1引言.
1.2蛋白質(zhì)在生命過程中的作用
1.3蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的一般概念
1.4蛋白質(zhì)的基本組成單位
1.5多肽鏈
1.6多肽鏈的構(gòu)象
1.7蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)
第2章蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次
2.1蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位
2.2維持和穩(wěn)定蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)的因素
2.3蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次
2.4小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第3章蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)和二級結(jié)構(gòu)
3.1蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)
3.2蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)
參考文獻(xiàn)
第4章蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu)Motif
4.1連接多肽
4.2蛋白質(zhì)中的超二級結(jié)構(gòu)
4.3頻繁發(fā)生的蛋白質(zhì)超二級結(jié)構(gòu)Motif類型
4.4超二級結(jié)構(gòu)的結(jié)構(gòu)特征描述
4.5簡單的超二級結(jié)構(gòu)Motif折疊組合成復(fù)雜超二級結(jié)構(gòu)Motif
參考文獻(xiàn)
第5章復(fù)雜超二級結(jié)構(gòu)Motif與折疊子類(Folds)
5.1復(fù)雜超二級結(jié)構(gòu)Motif折疊組合高級結(jié)構(gòu)
5.2折疊子類
5.3折疊子與結(jié)構(gòu)類型
參考文獻(xiàn)
第6章蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)與結(jié)構(gòu)域
6.1蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)
6.2結(jié)構(gòu)域
6.3球狀蛋白質(zhì)和結(jié)構(gòu)域的解剖學(xué)
6.4蛋白質(zhì)(結(jié)構(gòu)域)立體結(jié)構(gòu)的比較
參考文獻(xiàn)
第7章蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)體系
7.1蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)
7.2蛋白質(zhì)體系
參考文獻(xiàn)
第8章蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)分析
8.1晶體結(jié)構(gòu)分析簡介
8.2蛋白質(zhì)晶體學(xué)簡介
8.3蛋白質(zhì)晶體生長
8.4數(shù)據(jù)收集和處理
8.5同晶置換法
8.6分子置換法
8.7同晶差值傅里葉法
8.8電子密度圖的計(jì)算和解釋
8.9結(jié)構(gòu)精修
參考文獻(xiàn)
第9章多維核磁共振技術(shù)
9.1多維核磁共振方法確定蛋白質(zhì)溶液三維結(jié)構(gòu)的基本原理
9.2提取蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)信息的多維核磁共振方法
9.3蛋白質(zhì)溶液三維結(jié)構(gòu)的計(jì)算
參考文獻(xiàn)
第10章蛋白質(zhì)溶液構(gòu)象的光譜技術(shù)
10.1紫外-可見差光譜
10.2熒光探針法
10.3圓二色譜..
10.4激光拉曼光譜
10.5紅外光譜在研究蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)中的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
第11章蛋白質(zhì)的二維結(jié)晶及結(jié)構(gòu)重建
11.1蛋白質(zhì)晶體的類型
11.2蛋白質(zhì)的二維結(jié)晶化
11.3膜蛋白二維晶體形成的機(jī)制與條件
11.4電鏡觀察與三維結(jié)構(gòu)重建
參考文獻(xiàn)
第12章蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)圖象分析與分子模擬技術(shù)
12.1計(jì)算機(jī)圖形學(xué)
12.2圖形顯示設(shè)備
12.3圖形系統(tǒng)和工作站
12.4生物大分子的分子模擬與計(jì)算機(jī)圖形技術(shù)
參考文獻(xiàn)
第13章蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測
13.1蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測概述
13.2正誤構(gòu)象的判斷
13.3現(xiàn)階段幾種主要的簡單評估函數(shù)方法
13.4基于知識的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測.
13.5蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
13.6利用計(jì)算機(jī)互聯(lián)網(wǎng)進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測
參考文獻(xiàn)
第14章蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究中的幾種數(shù)理方法
14.1遺傳算法
14.2人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法
14.3統(tǒng)計(jì)物理學(xué)方法
14.4一些數(shù)理方法算法的進(jìn)一步討論
參考文獻(xiàn)
第15章蛋白質(zhì)分子動(dòng)力學(xué)
15.1分子動(dòng)力學(xué)模擬方法
15.2經(jīng)驗(yàn)力場和位能函數(shù)
15.3能量優(yōu)化
15.4自由能計(jì)算
15.5模擬退火技術(shù)
15.6環(huán)境效應(yīng)
15.7簡振模分析
參考文獻(xiàn)
第16章蛋白質(zhì)工程與藥物分子設(shè)計(jì)
16.1什么是蛋白質(zhì)工程
16.2蛋白質(zhì)工程領(lǐng)域的開創(chuàng)性工作
16.3蛋白質(zhì)的改性及分子設(shè)計(jì)——當(dāng)前蛋白質(zhì)工程研究的熱點(diǎn)之一
16.4基于生物大分子結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)——當(dāng)前蛋白質(zhì)工程
16.5蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測與藥物分子設(shè)計(jì)
16.6尚待解決的問題和充滿希望的前景
參考文獻(xiàn)
第17章蛋白質(zhì)的分子進(jìn)化
17.1分子進(jìn)化鐘與中性理論
17.2功能相關(guān)的分子進(jìn)化與非中性分子進(jìn)化
參考文獻(xiàn)
第18章酶分子的結(jié)構(gòu)與功能
18.1酶分子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
18.2酶催化作用特點(diǎn)
18.3酶的分類和命名法
18.4酶的抑制作用
18.5調(diào)節(jié)酶
18.6羧肽酶A的催化功能和分子結(jié)構(gòu)
18.7多酶復(fù)合物
參考文獻(xiàn)
第19章蛋白質(zhì)的分子運(yùn)動(dòng)
19.1蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)
19.2蛋白質(zhì)分子的運(yùn)動(dòng)
19.3展望.
參考文獻(xiàn)
第20章電子傳遞蛋白的結(jié)構(gòu)與功能
20.1細(xì)胞色素c
20.2鐵硫蛋白
20.3藍(lán)色銅蛋白
20.4黃素氧還蛋白
參考文獻(xiàn)...
附錄用傅里葉變換方法進(jìn)行三維重構(gòu)的一般原理